Formiranje eukariotske ćelije bilo je drugi najvažniji (nakon pojave samog života) evolucijski događaj. Glavna i fundamentalna razlika između eukariota i prokariotskih organizama je prisustvo naprednijeg sistema genoma. Zahvaljujući pojavi i razvoju ćelijskog jezgra, naglo se povećao stepen prilagodljivosti jednoćelijskih organizama na redovno promenljive uslove postojanja i sposobnost brzog prilagođavanja bez unošenja značajnih naslednih promena u genski sistem.
Eukariotska stanica, čija je citoplazma područje aktivnih metaboličkih procesa, uspješno odvojena od zone skladištenja, čitanja i reduplikacije genetskih informacija, pokazala se sposobnom za dalju biološku evoluciju. Ovaj epohalni i sudbonosni evolucijski događaj, prema naučnicima, dogodio se najkasnije prije 2,6 milijardi godina na spoju dvije geološke prekretnice - arhejske i proterozojske.
Rast prilagodljivosti i stabilnosti bioloških struktura je neophodan uslov za punu biološku evoluciju. Upravo svojom visokom sposobnošću prilagođavanja eukariotska ćelija je mogla evoluirati u višećelijske organizme sa složenom strukturnom organizacijom. Zaista, u višećelijskim biološkim sistemima, ćelije sa istim genomom, prilagođavajući se promenljivim uslovima, formiraju tkiva koja su potpuno različita, kako po svojim morfološkim svojstvima tako i po funkcionalnosti. Ovo je velika evoluciona pobjeda eukariota, koja je dovela do pojave tako grandioznog raznolikosti životnih oblika na planeti i ulaska u evolucijsku arenu samog čovjeka.
Struktura ćelija eukariotskog tipa ima nekoliko karakterističnih karakteristika koje nisu karakteristične za prokariote. Eukariotska ćelija sadrži veliku količinu genetskog materijala (90%), koji je koncentrisan u hromozomskim strukturama, što osigurava njihovu diferencijaciju i specijalizaciju. Bilo koju eukariotsku ćeliju karakterizira prisustvo zasebnog jezgra. Ovo je glavna karakteristika ove vrste ćelija. Još jedna važna razlika od prokariota su organele eukariotske ćelije - stalne i raznolike unutarćelijske strukture.
Eukariotska ćelija, u poređenju sa prokariotskom, ima složeniji višestepeni sistem percepcije različitih supstanci. U prirodi ne postoji tipična univerzalna ćelija eukariotskog tipa. Svi onikarakteriše nevjerovatna raznolikost, koja je posljedica upravo potrebe za evolucijskom adaptacijom. Vrlo važna karakteristika eukariota je njihova inherentna kompartmentalizacija - lokalizacija svih biohemijskih procesa u odvojenim ćelijskim odjeljcima razdvojenim intracelularnom membranom. Eukarioti imaju niz složenih strukturnih komponenti. Kao što je sistem membrana; citoplazmatski matriks, koji je glavna intracelularna supstanca; ćelijske organele su glavne funkcionalne komponente eukariota.