Kombinativna varijabilnost je glavni razlog za intraspecifičnu raznolikost svih živih organizama. Ali ova vrsta genetske modifikacije samo dovodi do formiranja nove kombinacije osobina koje su već prisutne. A kombinativna varijabilnost i njeni mehanizmi nikada ne uzrokuju pojavu bilo kakve fundamentalno različite kombinacije gena. Pojava potpuno novih svojstava zbog različitih genskih varijacija moguća je samo u slučaju intraspecifičnih mutacijskih promjena.
Kombinativna varijabilnost određena je prirodom reproduktivnog procesa. Ovu vrstu modifikacije gena karakteriše pojava novih genotipova zasnovanih na novoformiranim kombinacijama gena. Kombinativna varijabilnost se manifestuje već u fazi formiranja gameta (polnih ćelija). Štaviše, u svakoj takvoj ćeliji je predstavljen samo jedan hromozom iz svakog homolognog para. Karakteristično je dahromozomi ulaze u zametnu ćeliju nasumično, zbog čega gamete u jednom organizmu mogu dosta varirati u smislu skupa gena. Istovremeno, u direktnom nosiocu nasljedne informacije nisu uočene nikakve hemijske transformacije.
Dakle, kombinativna varijabilnost je posledica različitih rekombinacija već postojećih gena u hromozomskom setu. Ova vrsta modifikacije gena također nije povezana s promjenama genskih i hromozomskih struktura. Izvori kombinovane varijabilnosti mogu biti samo procesi koji se dešavaju tokom redukcijske diobe ćelija (mejoze) i oplodnje.
Elementarna (najmanja) jedinica raznih rekombinacija nasljednog materijala, koja uzrokuje stvaranje novih kombinacija gena, naziva se rekon. Svaki takav recon odgovara dva nukleotida (građevinski blokovi nukleinskih kiselina) u dvolančanim DNK molekulima i jednom nukleotidu kada je u pitanju jednolančana struktura nukleinske kiseline virusa. Rekon se ne deli tokom crossing overa (proces razmene između uparenih homolognih hromozoma tokom konjugacije) i u svim slučajevima se prenosi u celini.
Kombinativne varijacije u eukariotskim ćelijama proizvode se na tri načina:
- Rekombinacija gena u procesu ukrštanja, što rezultira formiranjem hromozoma sa novim kombinacijama alela.
- Nezavisna nasumična divergencijahromozoma tokom anafaze prve faze mejotičke diobe, kao rezultat toga sve gamete dobijaju vlastite genetske karakteristike.
- Slučajni susreti zametnih ćelija tokom oplodnje.
Tako, kroz ova tri mehanizma kombinovane varijabilnosti, svaka ćelija zigote nastala fuzijom gameta dobija potpuno jedinstven skup genetskih informacija. Upravo te nasljedne modifikacije objašnjavaju ogromnu intraspecifičnu raznolikost. Genetska rekombinacija je izuzetno važna za evoluciju bilo koje biološke vrste, jer stvara neopisivu raznolikost genotipova. To je ono što svaku populaciju čini heterogenom. Pojava organizama obdarenih vlastitim individualnim osobinama predodređuje visoku efikasnost prirodne selekcije, dajući joj priliku da ostavi samo najuspješniju kombinaciju nasljednih osobina. Kroz uključivanje novih organizama u reproduktivni proces, genetski sastav se kontinuirano poboljšava.