U biologiji, da bi se opisao određeni organizam, koji pripada carstvu životinja, gljiva ili biljaka, razvijena je sopstvena nomenklatura. Odražava pripadnost jednoj vrsti, ovisno o karakteristikama morfologije i izgleda. Za životinje se primjenjuju kriteriji za označavanje vrste, ovisno o sposobnosti da proizvedu plodno potomstvo tokom oplodnje. Međutim, ovi obrasci se odnose samo na ove organizme, dok se mikrobi ne mogu klasificirati na ovaj način.
Koncept soja u mikrobiologiji
Zbog prisustva ogromnog broja organizama koji imaju morfološka svojstva, ali različite biohemijske i imunološke karakteristike, nemoguće je primijeniti standardnu nomenklaturu za imenovanje. Kao rezultat toga, uveden je koncept kao što je soj. Ovo je čista kultura mikroba koja je izolirana i izolirana na određenom mjestu u određeno vrijeme.
Svaki mikrob koji pripada jednom soju sličan je drugom takvom predstavniku u smislu biohemijskih, morfoloških, imunoloških i genetskih kriterijuma. Ali unutar iste bakterijske vrste, takva analogija nije uočena. Stoga je soj fleksibilniji naziv za mikrobnu kulturu. Jer brzorazmjena genetskog materijala (mutacija) dovodi do pojave novih organizama unutar vrste, ali sa različitim svojstvima, upravo ova definicija nam omogućava da preciznije karakteriziramo faktore patogenosti i virulencije.
Bakterijski sojevi
Postojeća nomenklatura bakterija omogućava klasifikaciju vrsta organizama, ali ne karakteriše njihova nova svojstva. Potonji se pojavljuju kao rezultat brze mutacije, stječući nova svojstva, uključujući ona patogena za ljude, farmske životinje i biljke, kao i druge mikrobe. Primjer nomenklature na primjeru Escherichia coli izgleda ovako: kraljevstvo - bakterije, tip - Proteobacteria, klasa gama-proteobacteria, red - Enterobacteriales, porodica Enterobacteria. Rod je Escherichia, a vrsta Escherichia colli. Međutim, postoje mnoge kulture bakterija vrste Escherichia colli koje pokazuju različita svojstva. Izolirani su u zasebne sojeve bakterija i imaju dodatno ime. Na primjer, Escherichia colli O157:H7.
E. coli je sama po sebi prisutna u ljudskom crijevu i ne uzrokuje bolest, ali je soj O157:H7 isključivo patogen zbog prisustva velikog broja faktora virulencije. Doživjela je epidemiju enterotoksigenih bolesti u posljednjih 5 godina.
Sojevi virusa
Koncept soja je fleksibilan naziv za organizme sa istim svojstvima koji su izolirani, a zatim identificirani i opisani u određenom području u određeno vrijeme. Svojim tokom virus može dobiti nova svojstva zbog antigenadrift. Ovo će stvoriti novi virusni soj, vjerovatno patogeniji od svog roditelja.
Možete jasno pokazati pojavu novih sojeva na primjeru virusa gripe. Pripada porodici ortomiksovirusa i nosi naziv u zavisnosti od antigena (hemaglutinina i neuraminidaze) HxNy. X i Y su numeričke vrijednosti koje odražavaju prisustvo antigena. Primjer je H5N1, poznat po nedavnoj epidemiji svinjske gripe s brzo progresivnim hemoragijskim pneumonijama. Prema teoriji, novi i opasniji soj se može razviti iz ovog soja zbog istog antigenskog drifta.
Gljivični sojevi i protisti
Plijesni su najmanje varijabilne od svih mikroba, iako je njihova biohemija također složena. Zbog složenije strukture od bakterija i virusa, ali i zbog nedostatka mehanizama za brzi prijenos gena, broj novih sojeva gljivica se neznatno povećava. Postoji i mišljenje da je svaki novootkriveni soj gljivica već postojeći organizam koji istraživačima jednostavno nije došao.
Slična situacija postoji u kraljevstvu protista. Njihova sposobnost mutacije je niska, pa je vjerovatnoća da će se novi sojevi brzo pojaviti izuzetno mala. Međutim, i dalje se pojavljuju nove varijante organizama iste vrste. Stoga su, očigledno, postojali i ranije, ali nisu otkriveni.
